O isolamento do novo retrovírus humano designado por VIH-2 levantou a possibilidade da eclosão de uma segunda pandemia da SIDA com as características e a magnitude idênticas às verificadas com a pandemia provocada pelo VIH-1. No entanto as características biológicas particulares do VIH-2, nomeadamente, o seu baixo potencial de transmissão, tanto por via sexual como por via vertical, contribuíram para uma distribuição mais regional deste vírus, atingindo uma maior expressão endémica na África Ocidental.

A organização molecular e a homologia genética do VIH-2 torna este vírus mais próximo do SIV do que do VIH-1. Do ponto de vista clínico, o espectro das infecções oportunistas e dos tumores associados à infecção pelo VIH-1. Por sua vez , estudos longitudinais controlados sugerem que as taxas de progressão para os estádios avançados de doença pelo VIH-1. O conhecimento dos mecanismos imunológicos e virulógicos que são responsáveis pelo controlo da patogenicidade do VIH-2 no hospedeiro humano pode contribuir para a compreensão de alguns fenómenos que se observam durante a história natural da infecção pelo VIH-1.